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1.氨基酸的脱氨基作用、碳骨架及氨的去向氨基酸的脱氨基作用即氨基酸失去氨基酸的作用。
①氧化脱氨基作用：氨基酸在酶的催化下氧化生成相应的酮酸并脱去氨基的过程。2
②转氨基作用：是指阿尔法氨基酸和阿尔法酮酸之间氨基的转移作用。在转氨酶的作用下，阿尔法氨基酸的氨基转移到阿尔法酮酸上变为相应的酮酸，而原来的酮酸转变为相应的氨基酸。
③联合脱氨基作用：联合脱氨基作用包括两种方式。
一种是以L谷氨酸脱氢酶为中心的联合脱氨基作用：氨基酸的氨基首先借助转氨基作用转移到受体分子阿尔法铜味儿酸性相应的阿尔法酮酸和谷氨酸。然后谷氨酸在L谷氨酸脱氢酶的作用下，经过氧化脱氨基作用脱去氨基又形成阿尔法酮戊二酸，α-酮戊二酸继续参加转氨基作用。
另一种是以嘌呤核苷酸循环为中心的联合脱氨基作用：氨基酸通过连续的转氨基作用，将氨基转移给草酰乙酸生成天冬氨酸，天冬氨酸与次黄嘌呤核苷酸反应生成腺苷酸代琥珀酸，进一步在裂解酶作用下，形成延胡索酸和腺嘌呤核苷酸。后者在腺苷酸脱氨酶催化下，脱去氨基生成次黄嘌呤核苷酸，完成氨基酸的脱氨基作用。
④非氧化脱氨基作用：大多在微生物体内进行。主要包括还原脱氨基作用，解氨酶脱氨基作用，脱水脱氨基作用等。
⑤脱酰氨基作用：谷氨酰胺和天冬酰胺可在谷氨酰胺酶和天冬酰胺酶的作用下分别发生脱酰氨基作用而形成相应的氨基酸和氨。
氨的去向：
⑴直接排出体外：大多数水生动物（排氨动物）如鱼类生活在水环境之中，他们对氨不需要做任何处理，可直接通过鳃排出体外。
⑵转变成尿酸：鸟类和陆生爬行类动物（排尿酸动物）以尿酸作为氨基酸氨基排泄的主要形式，尿酸同时也是灵长类鸟类和陆生爬行类动物嘌嘌呤代谢的最终产物。
⑶转变成尿素：主要通过两种途径：精氨酸的分解途径和嘌呤的降解途径。精氨酸分解途径由精氨酸酶催化形成鸟氨酸和尿素。嘌呤的降解途径是指嘌呤分解产生的尿囊酸在酶的催化下产生尿素。尿素循环也称为鸟氨酸循环或Krebs-Henseleit循环，是最早发现的循环代谢途径。
①瓜氨酸的合成：此阶段的反应发生在线粒体内胱氨酸，合成的前体物质是鸟氨酸和氨甲酰磷酸。鸟氨酸转氨甲酰酶位于线粒体基质中，形成的瓜氨酸随后离开线粒体进入细胞质中，随后的尿素循环反应阶段在细胞质中进行。
②精氨酸的合成：首先转移到细胞。质中的瓜氨酸在精氨琥珀酸合成酶催化下与天冬氨酸形成精氨琥珀酸。其次精氨琥珀酸在金安琥珀酸裂解酶催化下，形成游离的精氨酸和延胡索酸，精氨酸是尿素的直接前体，延胡索酸可进入三羧酸循环转变为草酰乙酸，草酰乙酸与谷氨酸通过转氨基作用又能重新形成天冬氨酸，这样就把尿素循环与三羧酸循环联系在一起了。
③尿素的形成：由精氨酸酶催化完成。它的作用是神尿素从精氨酸分子上水解下来，并生成鸟氨酸，鸟氨酸通过线粒体内膜上的转运载体进入线粒体，再次进入尿素循环。
氨基酸碳骨架的去向：
①生成糖：一些氨基酸的碳骨架在体内被代谢为丙酮酸或三羧酸循环途径中的中间产物（α-酮戊二酸，琥珀酰CoA，延胡索酸和草酰乙酸），它们作为糖异生的前体可生成葡萄糖，这类氨基酸称为生糖氨基酸。
②生成酮体：一些氨基酸的碳骨架在体内被代谢为乙酰CoA或乙酰乙酰CoA，前者为合成酮体的原料，后者为酮体合成途径的中间物，这些氨基酸称为生酮氨基酸。
③生糖兼生酮氨基酸：苏氨酸，异亮氨酸，色氨酸，酪氨酸和苯丙氨酸这五种氨基酸的碳骨架较大，其中一部分碳原子成为葡萄糖合成的前体，另一部分碳原子被代谢成乙酰CoA或乙酰乙酰CoA，这些氨基酸称为生糖兼生酮氨基酸。
④重新合成氨基酸：氨基酸的碳骨架可被重新利用，经转氨作用重新合成氨基酸。
⑤氧化释放能量：氨基酸的碳骨架可经三羧酸循环彻底氧化为二氧化碳和水，并释放能量。
2.氨基酸生物合成的碳骨架来源
一碳基团通常结合在四氢叶酸的N5，N10位上。
一碳单位主要来源于甘氨酸，丝氨酸，苏氨酸和组氨酸的代谢。
除此之外，一碳单位还参与嘌呤，胸腺嘧啶的生物合成，与生物体内许多生物活性物质的生物合成有关。
3.细胞内蛋白质的降解途径
细胞内的蛋白质可分为外源蛋白质和内源蛋白质。
外源蛋白质可通过哺乳动物胃，小肠中的胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、羧肽酶、氨肽酶、弹性蛋白酶水解成游离氨基酸，在被小肠吸收后，通过血液循环进入肝脏及其他组织中进一步降解或转化。
内原蛋白质有两条降解途径：
一是溶酶体途径：主要降解细胞通过胞吞作用摄取的外源蛋白，膜蛋白及长寿命的细胞内蛋白，不依赖于APP，没有选择性。
二是泛素蛋白-酶体途径：主要降解异常蛋白和积累过多的调节蛋白，经多聚泛素化修饰后携带降解标记在26S蛋白酶体中被降解，依赖ATP，有选择性。
4.蛋白质合成体系的重要组分
①mRNA及遗传密码：MRNA是蛋白质的合成模板，直接决定多肽链中氨基酸的顺序。遗传密码具有方向性，无标点，不重叠性，简并性，有起始密码子和终止密码子，基本通用性。
②tRNA：能够按照mRNA上的密码子所决定的氨基酸顺序，将氨基酸转运到核糖体的特定部位。
关键部位：一是3C‘的氨基酸结合部位，二是与MRNA密码子结合的反密码子，反密码子与密码子配对时，密码子的第一、二位碱基严格配对，第3位可有变动（同工受体tRNA：携带相同氨基酸而反密码子不同的一组tRNA）
③核糖体是蛋白质合成的场所，由几十种蛋白质和rRNA组成。
④辅因子：蛋白质的合成在起始，延伸和终止阶段，还需一系列蛋白质服辅因子参与。
5.大肠杆菌中蛋白质的合成过程
①氨基酸的活化：氨基酸与携带它的TR na结合成氨酰TRna的过程，由氨酰tRNA合成酶催化。（氨酰tRNA合成酶高度专一，每一种氨酰tRNA合成酶既能识别一种特异的氨基酸，又能识别携带该按氨基酸的一组同工受体TRNA。）
②肽链合成的起始：形成70S复合物的过程，在70S起始复合物中fMet-tRNA fMet位于核糖体P位点，其反密码子与mRNA起始密码子AUG配对，核糖体A位点空缺，需起始因子IF-1，IF-2，IF-3参与。
③肽链的延长：每个延伸循环包括进位，传太医为需延伸因子EF-Tu和EF-Ts参与。
④肽链合成的终止和释放：终止密码子UAA、UAG、UGA中，任何一个出现在核糖体a位点时没有相应的氨酰tRNA能识别，这时释放因子（RF-1，RF-2，RF-3）便识别并结合上去，使大亚基肽酰转移酶转变为酯酶功能，水解连接肽链与P位点tRNA的肽酰酯键，使肽链从核糖体上释放，tRNA、mRNA也从核糖体上释放，70s核糖体解体。
6.蛋白质合成后的加工及定向输送
肽链合成后加工：
⑴肽链的修饰：
①肽链N端的修饰（N端fMet或Met切除）；
②部分肽段的切除；
③二硫键的形成；
④个别氨基酸的修饰；
⑤添加辅因子。
⑵肽链的折叠：分子伴侣能协助多肽链的正确折叠，蛋二硫键异构酶可催化错配的二硫键断裂并形成正确二硫键连接，最终使蛋白质形成热力学最稳定的天然构象。肽酰-脯氨酰。顺反异构酶可促成多肽链中脯氨酸亚氨基参与的肽链的顺反异构体之间的转换。
蛋白质的定位：
⑴信号序列：引导蛋转移到细胞的适当靶部位，通常由15~60个氨基酸残基组成。
⑵定向穿越途径：
①翻译转运同步途径；
②翻译后转运途径。
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